新疆地質局水文環境地質調查中心（簡稱“水環中心”）由原新疆地礦局第一水文工程地質大隊（1957年成立）和第二水文工程地質大隊（1978年成立）根據《自治區地勘事業單位改革實施方案》要求進行合並重組，於2024年5月25日宣布成立，為新疆地質局下屬正處級公益一類事業單位。主要承擔基礎性、公益性水文地質、工程地質、環境地質、地質災害防治、生態修複保護等調查工作。截至2025年2月，中心共有在編職工319人，其中專業技術人員199人，含正高級職稱12人、副高級職稱115人、中級職稱58人、初級職稱14人。水環中心堅持以習近平生態文明思想為指導，以推動新疆經濟社會高質量發展為目標，聚焦自治區“十大產業集群”建設，主動服務自治區水資源勘查開發、生態文明建設、新型城鎮化建設、鄉村振興戰略，積極介入地熱資源開發、水土資源調查、山水林田湖草沙綜合治理、流域水土環境綜合整治、特色農果業、水土汙染治理、特色地質景觀資源調查等領域，先後獲省部級及行業級獎項共計兩百餘項，包括原國土資源部“全國地質勘查行業優秀地質找礦一等獎”、建設部“優秀勘察設計一等獎”、自治區國土資源科技進步一等獎等。近年來，累計完成各地州市水資源調查以及重要能源基地供水、整裝勘查開發區供水和防病改水等水文地質勘查項目600餘項，找到和評價大、中型水源地90餘處。在塔縣圈定並評價了全疆首個大型高溫地熱田，填補了全疆高溫地熱田的空白；陸續在溫泉縣、拜城縣、烏恰縣等地圈定地熱田及地熱靶區30餘處，為新疆清潔能源勘查開發提供了詳實依據。承擔完成各類地質環境治理和地質災害防治項目數百項，消除了災害對近30萬人的直接威脅，保護了數十億元國家財產安全，為維護新疆社會穩定、人民安居樂業做出了顯著貢獻。