自然資源部中央地質勘查基金管理中心是自然資源部直屬公益一類事業單位，編製50人。受財政部、自然資源部共同委托，負責中央地質勘查基金的組織實施及日常管理工作。主要職責是：一、負責擬定中央地質勘查基金有關具體實施辦法及日常管理規章製度。二、研究製定並實施中央地質勘查基金項目總體規劃。三、組織實施中央地質勘查基金項目。草擬中央地質勘查基金項目立項文件，組織項目立項，提出項目建議，監督項目執行，驗收項目成果。四、負責申請登記中央地質勘查基金獨資項目的礦業權，依法管理中央地質勘查基金投資權益。五、負責中央地質勘查基金資金管理。組織編報項目費、組織實施費預算建議，負責預算落實並對各項資金的使用情況進行監督管理。編報和執行本機構年度經費預算。六、分析礦產資源勘查國內外市場形勢，反映中央地質勘查基金項目實施和管理動態，開展中央地質勘查基金項目和專家數據庫建設。七、負責辦理有關監督、管理國家出資形成的礦業權價款折股股權的事宜。八、研究實施國家礦產資源戰略儲備製度,承辦有關礦產地儲備的具體工作。九、承辦國外礦產資源風險勘查專項具體組織實施工作。十、承辦中央地質勘查基金對省級地質勘查基金的業務指導的具體工作。十一、承辦財政部、自然資源部交辦的其他事項。